Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM53BQ14153 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms