Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TUBA3CQ13748 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TUBA3CQ13748 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TUBA3CQ13748 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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TUBA3CQ13748 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TUBA3CQ13748 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBA3CQ13748 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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