Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAPSNQ13702 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms