Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1SQ13698 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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