Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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