Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PMS2P3Q13401 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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