Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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