Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR1H3Q13133 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms