Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAF1AQ13111 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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