Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms