Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXF1Q12946 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXF1Q12946 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXF1Q12946 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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FOXF1Q12946 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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