Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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TRAF2Q12933 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF2Q12933 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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