Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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