Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
STX4Q12846 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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STX4Q12846 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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STX4Q12846 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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STX4Q12846 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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STX4Q12846 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
STX4Q12846 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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STX4Q12846 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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STX4Q12846 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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