Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BPTFQ12830 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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