Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROQ12816 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROQ12816 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROQ12816 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROQ12816 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
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