Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP1B1Q10567 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP1B1Q10567 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms