Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB2Q08289 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms