Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A2Q05940 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms