Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLOD1Q02809 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms