Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms