Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms