Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms