Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F1Q01094 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms