Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORDQ00796 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SORDQ00796 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms