Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTCQ00610 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms