Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD1P98174 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD1P98174 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms