Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms