Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms