Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA9P57773 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms