Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms