Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP9P55211 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms