Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HADHBP55084 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HADHBP55084 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms