Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms