Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms