Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP98P52948 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP98P52948 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP98P52948 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP98P52948 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP98P52948 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP98P52948 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP98P52948 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP98P52948 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP98P52948 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms