Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA1P52294 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA1P52294 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms