Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms