Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIP4K2AP48426 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms