Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms