Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms