Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHI3L1P36222 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms