Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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PTPRMP28827 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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PTPRMP28827 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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PTPRMP28827 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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PTPRMP28827 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRMP28827 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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