Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PEX2P28328 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms