Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms