Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRGP23470 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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PTPRGP23470 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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PTPRGP23470 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PTPRGP23470 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PTPRGP23470 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PTPRGP23470 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PTPRGP23470 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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