Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPCAMP16422 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms