Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRF1P14222 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms