Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms