Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8BP10966 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8BP10966 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms